Card Captor Sakura handelt von der 10-jährigen Sakura Kinomoto.
Sakura lebt mit ihrem Vater Fujitaka und ihrem Bruder Toya zusammen, sie ist sehr sportlich und kocht gerne.
Sie schwärmt total von dem besten Freund ihres Bruders - Yukito - und freut sich immer wenn er da ist.
Eines Tages entdeckt Sie im Arbeitszimmer ein Buch - das "Clow Book". Als sie es öffnet findet sie dort verschiedene Karten, und als sie den Namen einer liest "Windy" kommt ein Windstoß auf, der alle Karten hinfortbläßt.
Anschließend entsteigt dem Titelblatt eine kleine Kreatur, die sich ihr als 'Kerberos - der Wächter des Siegel's' vorstellt. Er offenbart ihr, das nur sie in der Lage ist, die Karten - welche von einem Chinesischen Magier namens Clow Lead geschaffen wurden - einzufangen und überreicht ihr einen kleinen Schlüssel.
Für Sakura beginnt nun: Die Jagd nach den Clow Card's
Einzige Vertraute ist ihre beste Freundin Tomoyo, die sie auch mit ihren verschiedenen Kostümen versorgt. 'Tomoyo liebt es auch ihre Freundin bei ihren Fang-Aktionen zu filmen.'
Die Karten stellen Sakura immer auf neue Proben und so wierd diese auch immer stärker (mit jeder eingefangenen Karte).
Im Laufe der Serie taucht ein chinesischer Junge namens Shaolan Li auf, der als Nachfahre von 'Clow Lead' ebenfalls auf der Suche nach dem Kartenwerk ist. (Anmerkung: Dieser wird bei Yukito's Anwesenheit immer sehr nervös) Nach anfänglichen Problemen werden die beiden - mehr oder weniger - zu einem Team.
Noch ein wichtiger Aspekt: In Sakura's Schule taucht eine geheimnisvolle Frau auf, die als neue Lehrerin unterrichtet (Mathematik). Toya scheint diese von früher her zu kennen und kann sie gut leiden, ebenso wie Sakura. Shaolan jedoch misstraut ihr sehr.
Diese Lehrerin spielt allerdings im Laufe der Geschichte noch eine große Rolle bis Sakura alle Karten eingefangen hat - und dann "Yue - dem Richter" gegenübersteht!